為使本部名稱更符合實際業務範疇,自2014年7月起,原「藥劑部」正式更名為「藥學部」,英文名稱仍維持 Pharmacy Department。

藥劑部門中文稱呼源自日本醫療體系,然而藥劑學僅是藥學的一門學問,本院藥師提供的服務,除傳統的調劑處方外,已擴展到臨床藥事照護、正確用藥推廣、參與公共政策以及藥學教育等多元化藥事服務,繼續使用藥劑部名稱已無法貼近實際業務範疇。
2014年7月~12月為藥學部更名過渡期,本部現已著手進行文件表單更新,院區指標將待二期擴建工程一併重整,造成不便,敬請見諒。

藥學部組織請參閱下圖。
藥學部組織圖